Büyük bir yangında Emiya Kiritsugu tarafından kurtarılıp evlatlık alınan Shirou, adaletin kahramanı olmak ister. Emiya Shirou, Kiritsugu'nun ölümünden yıllar sonra okulun okçuluk dojosunu temizlerken, insanüstü varlıklar olan hizmetkârların savaşına tanıklık eder. Kaçmaya çalışsa da hizmetkârların birinden ölümcül yara alır. Bu olaydan mucizevi şekilde kurtulan Shirou, başladığı işi bitirmeye kararlı olan hizmetkârla dövüşürken hizmetkârı Kılıç'ı çağırır ve ödülü her şeye gücü yeten Kutsal Kâse olan 5. Kutsal Kâse Savaşı tam anlamıyla başlar.