Will Travers, 11 Eylül terör olaylarında karısını ve çocuğunu kaybetmiş, API adlı istihbarat örgütünün en zeki çalışanlarından biridir. İlginç olaylar, yine API örgütünde çalışan Will'in kayın pederinin esrarengiz bir şekilde bir tren kazasında hayatını kaybetmesiyle başlıyor. Will, bu kazanın ardından kaptığı araştırmalar sonucunda bunun bir komplo olduğunu ve bu komplonun sırada ki kurbanının kendisi olduğunu öğreniyor.Rubicon, 70'li yıllarda Amerikanın paranoya dönemlerinde çekilmiş olan "All The President's Men", "Three Days of the Condor" ve "The Parallax View" gibi komplo filmlerinden esinlenmiştir. Dizinin senaryosu çok ağır ilerlesede hikaye oldukça ilgi çekici.